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余永国博士
从“试错模式”到“一击即中”，NGS助力遗传病研究及诊疗发展
嘉宾简介：
余永国，儿科学博士，副主任医师，副研究员，硕士生导师，上海交通大医院儿科内分泌/遗传科副主任医师，同时兼任上海市儿科医学研究所分子诊断平台负责人、课题组PI，浦江学者,美国哈佛大学博士后。近年来，余永国承担多项 及市级课题；发表SCI论文30余篇(总影响因子分)，回国后，成功搭建了基因芯片和二代测序诊断与研究平台。
随着医疗技术水平的提高，人类的疾病谱已发生了巨大的变化。近些年，国内新生儿死亡率持续下降，而出生缺陷问题却日益凸显。神经发育障碍、遗传性代谢病、重要脏器结构畸形等严重影响婴幼儿的生存和生活质量，成为导致儿童死亡和病残的主要原因。这些病童如同来自遥远的外太空，就像“星星的孩子”，承受着其脆弱的身体不可承受之重， 诊断及治疗儿童遗传病成了至关重要的一环。
在基因测序技术蓬勃发展的当下，基因测序市场日益繁荣，基因技术改变了传统的医疗观念，也为遗传病的检测提供了更加简便而有效的手段，NGS等新兴技术也发挥着愈发强大的作用。日前，测序中国专访了上海交通大医院、上海市儿科医学研究所余永国博士。面对儿童遗传性疾病日益严峻的形势，余永国博士畅谈了当前遗传病的诊疗现状，就NGS数据的解读、数据共享以及遗传咨询等热点问题发表了独到的的见解，并就测序技术在遗传病中的应用进行了详细的临床案例分析。
一、颠覆“试错模式”，迈向 时代
测序中国：能否向大家介绍一下您的团队，医院儿科研究所主要针对哪些人群进行遗传研究或检测？
余永国博士：我们团队是上海交通大医院，上海市儿科医学研究所儿童内分泌/遗传科，我们科室分成四个平台——医生平台、生化平台、分子平台和细胞平台。
医生平台目前有11位内分泌/遗传科的医生，一方面主要负责儿童内分泌遗传代谢性疾患、遗传咨询、儿童遗传及产前咨询等诊断和治疗，另一方面负责实验室报告的审核和签署；生化平台主要进行特殊生化检测，包括新生儿筛查，血、尿串联质谱，代谢性疾病的酶学测定（戈谢病、粘多糖、脑白质病及溶酶体病等）以及检验科不开展的特殊激素和生化检测等；分子平台主要负责患者的分子诊断和产前诊断，包括一代测序（Sanger）及其衍生技术、新一代测序（NGS）技术和基因芯片技术等；细胞平台主要负责孕妇无创产筛、羊水培养、染色体核型、FISH检测等。
目前，我们的团队主要针对儿童内分泌遗传病因比如矮小、性早熟、性腺发育不良，代谢性疾患如 酸代谢、有机酸代谢、糖代谢及脂肪代谢障碍性疾患，儿童出生缺陷的遗传病因及产前遗传咨询等领域进行研究、诊断和治疗。
测序中国：在您的实验室，哪些疾病可以通过NGS技术受益？
余永国博士：传统的遗传性疾患诊断策略是“试错模式”，医生必需预先诊断，再通过基因检测验证，由于不同的医生对不同的疾病认知不同，同样的患者在不同的医生那里得到的诊断和检测差次不齐。随着现代生物医学新技术，尤其是NGS技术在临床研究中的应用，传统的诊断策略将被颠覆，诊断模式可以一步到位，变得更加 ，无需医生预先诊断，筛查结果会提示疾病表型，适用范围扩大到人类数千种遗传病，甚至可发现新的疾病，诊断过程也转为由里到外，先筛查基因，得到答案，再用其他实验室检查验证。
比如对于内分泌常见的疾患，如两性畸形和尿道下裂，传统来说我们的思路是综合患者的外观性别、激素性别、器官性别、基因性别、基因突变分析及心理性别来进行综合判断。但实际上导致性腺发育不良的基因众多，目前已知的就有~个，传统的诊断思路不可能一下子就通过临床和生化检测判断是哪个基因导致的。所以在很长一段时间中，传统的诊断思路就是“试错”，通过一代测序先检测一个基因，如果结果是阴性再检测另外一个基因，然后以此类推，反复检测。
这种传统的“试错”模式不但延缓了诊断时间，而且需要反复取样，既增加病人的痛苦又提升了检测成本，同时也需要技术人员进行重复劳动。随着NGS技术的发展，这个弊端会消除，通过基因Panel测序或者全外显子测序，只需要一次取样并进行一次实验，就可以将目前已知的导致性腺发育不良的~个基因，甚至全基因组层面与遗传病相关的几千个基因，乃至新的致病基因都挖掘出来。这不但可以在成本可控的前提下提高通量，而且一次取样就可以得到大量信息，极大减轻了患者痛苦，加快了由样本到报告的流程，为进一步治疗争取到了宝贵的时间。所以NGS可以说是现阶段可以使用，未来也更值得期待的技术。
余永国博士
二、数据分析：不容忽视的“最终环节”
测序中国：对于NGS从前期样本制备到测序及数据分析，您怎样评价目前市面上的相关产品，在这些环节中您最
